Pseudomonas infection in a respiratory care unit (RCU)

 A. M AL- Abbasi *, Manhal FS** and Mohammad NRS**.

Dept. of Med., Collage. Of Medicine ,University  of Baghdad, Baghdad, Iraq.

**Dept. of Microbiology e- mail: abbshaifa@yahoo.com

Background: Pseudomonas infection of surgical wards, burns units and intensive care units is common with a growing problem associated with multiple antimicrobial resistance and increasing morbidity and morality rates.

Objectives: to find out the rate of nosocomial infection among the respiratory care unit of the Specialized Surgical Teaching Hospital in Baghdad, with a special emphasis to pseudomonas group, their typing and antimicrobial resistance.

During one year (June2004-June 2005) there were 120 patients among 228 cases admitted to the RCU and these 120 patients needed mechanical respiration through orotracheal, nasotracheal tubes or tracheostomy; they were of different medical and surgical causes. The period of stay in the RCU was between 8-40 days. Microbial isolation for the final diagnosis of ventilator- associated respiratory tract infection (VARI) was done by sputum culture, endotracheal aspirate and bronchoalveolar lavage (BAL) in the following manner of colony forming units/ml: 10, 10, and 10 respectively. Further typing of pseudomonas isolates was done by using API 20 NE BioMerieux system, serotyping, antibiotyping and pyocin typing with spotting methods. Examination of the unit staff and environment was also done.

 Results: number of patients was 120 cases, they were 72 males and 48 females aged between 0.2 -48years. VARI rate was among 61 patients (50.8%). The isolates were mainly Gram-negative (53) isolates, pseudomonas spp. comprised 30 of them, 13 for Klebsiella pneumoniae, 5 for Acinetobacter spp. 3 For H. influence and one isolate for each of E. coli and proteus spp . For Gram-positive bacteria,S. aureus comprised 6 isolates and S. pneumoniae was present among two isolates. Further five pseudomonas isolates were present among hospital staff were examined for typing. Of the 35 p. aeroginosa isolates, 9 biotypes were recognized in specimens from colonized and infected patients as well as from hospital environmental specimens were 0:16 followed by 0:11, 0:2, 0:6, 0:5 and 0:4.

The antimicrobial susceptibility was as following: fully susceptible: 22.9%, fully resistant 20% and mixed susceptibility among 57.1%.

Conclusion:

Infection of RCU and contamination of the environment and staff of the setting by different drug- resistant microbe's especially P. aerogenosa species was common. Prior antibiotic use to admission to the RCU caused higher rates of colonization and VARI. Many biotypes were shared in specimens from colonized and infected patients together with the hospital environment contamination.

مضادات حيوية أصيلة مفرزة من طرف سلالة جديدة تابعة للجنس Saccharothrix معزولة من تربة صحراوية

عبد الغني زيتوني1، بوبكر باجي1، أحمد لبريحي2، نصرالدين سباو1

1 مخبر البحث في المواد الفعالة وتثمين الكتلة الحية, المدرسة العليا للأساتذة-القبة (الجزائر).

2 مخبر الهندسة الكيميائية، المدرسة الوطنية العليا للفلاحة، كاستاني-تولوزان، تولوز (فرنسا).

هدف الدراسة: تضمن هذا البحث دراسة تصنيفية لسلالة بكتيرية من جنس Saccharothrix (Actinomycetales) عزلت من تربة صحراوية، ودراسة معمقة للمضادات الحيوية التي تفرزها.

الطرق المتبعة: لتحديد تصنيف السلالة SA103 تم دراسة خواصها المورفولوجية، الكيميائية (تحليل المركبات الخلوية) والجزيئية (تحديد تسلسل القطعة المورثيةrDNA 16S). تم إنتاج المضادات الحيوية بإنماء السلالة في الوسط ISP2، وتم إستخلاصها بواسطة n-butanol ثم تنقيتها بإستعمال الكروماتوغرافيا العمودية (Sephadex LH20) والكروماتوغرافيا السائلة فائقة التجلية (HPLC) على حامل من نوع C18. إستعملت الدراسات الطيفية للأشعة فوق البنفسجية-المرئية، تحت الحمراء، طيف الكتلة وطيف الرنين المغناطيسي النووي للبروتون وللكربون C13 لتحديد البنية الكيميائية للمضادات الحيوية النقية. كما حددت التراكيز الدنيا المثبطة (MIC) ضد العديد من الكائنات الدقيقة الممرضة للإنسان أوالمفرزة للسموم.

النتائج: بإعتبار الخواص المورفولوجية، الكيميائية والجزيئية، تم إلحاق السلالة SA103 بالجنس  Saccharothrix، لكن لوحظ أن هذه السلالة تبدي عددا من الفروق الفسيولوجية مع الأنواع المعروفة حاليا، إضافة إلى أن دراسات الإنتساب الجينية (Phylogeny) أوضحت حقا أنها مختلفة وجديدة.

 تفرز السلالة SA103 إثنا عشر (12) مضادا حيويا: سبع منها ينتمي لمجموعة الموتاكتيميسين (Mutactimycine) التابعة لعائلة الأنتراسكلين (Anthracycline)، ثلاث لعائلة الماكروليد (Macrolide) وإثنان إلى عائلة النكليوتيد (Nucleotide).

من بين الموتاكتيميسينات، تعد واحدة معروفة سابقا (Mutactimycine C) وهي تنتج من قبل سلالة طافرة من جنس Streptomyces، أما الستة المتبقية فهي مشتقات جديدة لم تعرف آنفا. للإشارة فإنه يعرف عن Mutactimycine C فعاليتها المضادة للسرطان.

ضمن الماكروليدات، تم إلحاق أحد المركبات بـAldgamycine G المعروف عند أحد أنواع الجنس Streptomyces، في حين أن المضادين الآخرين أصيلين وتم تحديد وربط بنيتهما بمجموعتي Aldgamycine و Swalpamycine.

فيما يخص المركبين الأخيرين المنتميان لعائلة النكليوتيد، أظهرت الدراسة أنهما ذا قطبية عالية وذوبان كبير في الماء، وبنيتهما لا تشبهان المركبات المعروفة لهذه المجموعة.

تملك المضادات الحيوية المفرزة التابعة لعائلة الموتاكتيميسين والماكروليد فعالية مثبطة خاصة ضد البكتيريا غرام (+)، منها الممرض للإنسان أو المفرز للسموم (Staphylococcus aureus، Listeria monocytogenes، الخ..). أما مركبات عائلة النكليوتيد فإضافة إلى فعاليتها تجاه البكتيريا موجبة الغرام، فهي مثبطة للعديد من الفطريات المفرزة للسموم مثل: Aspergillus ochraceus، A. carbonarius، Fusarium culmorum، F. graminearum، Penicillium citrinum، الخ.. .

الخاتمة: تبين في دراستنا إحتمال كون السلالة SA103 نوعا جديدا ضمن الجنس Saccharothrix. تنتج هذه السلالة 12 مضادا حيويا فعالا ضد البكتيريا و/أو الفطريات و هي تنتمي إلى 3 عائلات مختلفة، 10 منها جديدة في حين تعد 2 معروفة سابقا.

في ضوء هذه النتائج المشجعة نحن عازمون مواصلة الدراسة على هذه الجزيئات قصد إستغلالها في مختلف المجالات الطبية والصيدلانية، الصناعات الغذائية، الفلاحة، البيطرة، الخ.. .

الكلمات المفتاحية: Saccharothrix، مضادات بكتيرية و فطرية، بنية كيميائية، فعالية حيوية.

Evidence for an extra-human reservoir for pneumococcal infections in pets and laboratory animals

Adnan Al-Lahham,

School of Applied Medical Sciences, German-Jordanian University, Amman, Jordan. Email: lahham@gmx.de

Between 1986 and 2006 Streptococcus pneumoniae was isolated from six pets treated in a medical veterinary laboratory and 36 laboratory animals during routine health monitoring in an animal facility. Isolates were obtained from mastomys (n=27), rats (n=4), guinea pigs (n=4), mice (n=3), dolphins (n=2), a horse and a cat. S. pneumoniae was isolated from nose, lung, trachea, abdomen, eye, wound and sterile body site. Nine animals showed disease symptoms. Two guinea pigs were C4-immune deficient, suffered from sepsis and died. One guinea pig, the cat and the horse were pets and suffered from severe respiratory problems. One pet Guinea pig had an infected head wound, several Mastomys suffered from conjuntivitis. The two Dolphins were zoo animals that died without showing symptoms of disease. Pneumococcal isolates were characterized by optochin sensitivity, bile solubility, gene probe, pneumolysin PCR, serotyping and multi locus sequence typing. Eighteen of the 42 isolates (43%) appeared to be optochin resistant. Serotypes found were 19F (guinea pigs), 14 (mastomys, mouse), 23F (dolphins), 3 (cat, horse) and 33A (mouse). All isolates were sensitive to penicillin, telithromycin and levofloxacin. Twenty-eighth isolates (mastomys, mouse) were ST 15 (serotype 14) a sequence type/serotype combination commonly found in human isolates. The cat isolate was ST 180 (serotype 3), both dolphin isolates were ST 440 (serotype 23F). Eleven isolates had new STs, six of which are close variants of known STs. Conclusion. All guinea pig isolates showed the same completely new combination of known alleles. The horse isolate showed an unknown allele combination and three new alleles.